Numéro
J. Phys. France
Volume 42, Numéro 2, février 1981
Page(s) 247 - 260
DOI https://doi.org/10.1051/jphys:01981004202024700
J. Phys. France 42, 247-260 (1981)
DOI: 10.1051/jphys:01981004202024700

Helix-coil transitions of dilute polymers under a velocity gradient

Y.H. Kim1, 2

1  Department of Physics, University of California, Los Angeles, CA 90024, U.S.A.
2  Current address : Polymer Group, Dept. of Metallurgy, University of Illinois, Urbana, Ill. 61801, U.S.A.


Abstract
A theoretical model of helix-coil transitions of polymers such as polypeptides under a velocity gradient is presented. A polymer in dilute solution is represented by a chain of alternating flexible coils and rigid rods which represent flexible segments and helical segments respectively. A time-independent homogeneous velocity gradient is introduced and the effects on the conformational properties of polymers are investigated. The numerical analysis of the model shows that if a velocity gradient is not too small, the effects are significant and considerable changes of conformational properties of polymers arise. In the latter part of the paper, the effects of the anisotropic excluded volume type interactions between helical segments are included in the model by a mean field approximation.


Résumé
On présente ici un modèle théorique sur la transition hélice-pelote des polymères, tels que des polypeptides, soumis à un gradient de vélocité. Un polymère dans une solution diluée est représenté par une chaine alternée de pelotes flexibles et de bâtons rigides qui représentent respectivement des segments flexibles et des segments hélicoïdaux. On introduit un gradient de vélocité homogène qui est indépendant du temps et on recherche les effets sur les propriétés de conformation des polymères. L'analyse numérique du modèle montre que si le gradient de vélocité n'est pas trop petit, les effets sont significatifs et produisent des changements considérables sur les propriétés de conformation des polymères. Dans la derniere partie de l'article, les interactions volume exclu anisotrope entre des segments hélicoïdaux sont inclus dans le modèle par l'approximation champ moyen.

PACS
3620E - Conformation (statistics and dynamics).
6125H - Macromolecular and polymer solutions; polymer melts; swelling.

Key words
liquid structure -- macromolecular configurations -- polymer solutions